同仁堂中药生产走过了一个从手工操作到现代化生产的历史过程。经过300余年的发展，制药工具、设备发生了巨大变化，生产的自动化水平迅速提高，人工的劳动强度降低，效率大大提高，质量保证体系更加完善。全系统共有九大生产基地，分布在北京亦庄、丰台、大兴、通州、昌平和香港大埔工业区。